Sprievodca nákupom mikrocentrifúgy na prípravu vzoriek DNA, RNA a proteínov

Výber mikrocentrifúgy nie je len o kúpe malej odstredivky s vysokou rýchlosťou. Pri príprave DNA, RNA, proteínov, enzýmov a bunkových lyzátov závisí správny výber od kompatibility skúmaviek, rozsahu RCF, kapacity rotora, konštrukcie veka rotora, potreby chladenia, bezpečnostných prvkov a denného objemu vzorky.

Táto príručka pomáha porovnávať molekulárne biologické laboratóriá, biochemické laboratóriá, univerzitné výskumné tímy a distribútorov možnosti mikrocentrifúgy  pre skúmavky s objemom 0,2 ml, 0,5 ml, 1,5 ml a 2 ml. Cieľom je pomôcť kupujúcim pri výbere praktickej konfigurácie na prípravu vzoriek v malom objeme namiesto výberu podľa otáčok za minútu alebo samotnej ceny.

Na čo sa používa mikrocentrifúga?

Pre maloobjemové laboratórne vzorky je určená mikrocentrifúga. Bežne sa používa pri príprave DNA/RNA, zrážaní proteínov, manipulácii s enzýmami, čírení bunkového lyzátu, rýchlom odstreďovaní, tvorbe peliet a separácii supernatantu. V týchto pracovných postupoch sa vzorky zvyčajne umiestňujú do mikroskúmaviek s objemom 0,2 ml, 0,5 ml, 1,5 ml alebo 2 ml.

Rôzne typy vzoriek vyžadujú rôzne priority nákupu. Používatelia DNA a RNA sa často zameriavajú na čisté zaobchádzanie, kompatibilitu skúmaviek, rýchle odstreďovanie a kontrolu kontaminácie. Užívatelia bielkovín a enzýmov sa môžu viac starať o tvorbu tepla, brzdenie a citlivosť vzorky. Pracovné postupy bunkového lyzátu môžu vyžadovať silnejšiu RCF na vyčírenie alebo tvorbu peliet.

Mikrocentrifúga by mala byť tiež odlíšená od minicentrifúgy. Mini odstredivka je užitočná pre jednoduché úlohy rýchleho odstreďovania. Vysokorýchlostná mikrocentrifúga je vhodnejšia, keď laboratórium potrebuje vyššiu RCF, silnejšie ovládanie rotora, lepšiu opakovateľnosť alebo konzistentnejšie rutinné používanie.

 

Kompatibilita tuby: 0,2 ml, 0,5 ml, 1,5 ml a 2 ml

Pre väčšinu pracovných postupov molekulárnej biológie sú štandardným východiskovým bodom 1,5 ml a 2 ml skúmavky. Kupujúci by si mali overiť, či rotor podporuje tieto trubice priamo a či značka trubice, štýl uzáveru, výška trubice a hodnotenie RCF zodpovedajú zamýšľanému použitiu.

Menšie skúmavky, ako sú 0,2 ml skúmavky PCR a 0,5 ml skúmavky, môžu vyžadovať adaptéry alebo špeciálne polohy rotora. Rotor navrhnutý pre skúmavky s objemom 1,5 ml a 2 ml nie vždy podporuje skúmavky PCR alebo skúmavky so stripmi. Ak laboratórium používa viacero veľkostí trubíc, všetky požadované adaptéry by mali byť pred objednávkou potvrdené.

Kapacita rotora by mala zodpovedať skutočnému pracovnému zaťaženiu. Malé univerzitné laboratórium môže potrebovať iba kompaktný 12-miestny rotor. Zaneprázdnené laboratórium molekulárnej biológie môže potrebovať možnosti s 18, 24 alebo vyššou kapacitou. Kapacita by mala byť vypočítaná podľa použiteľného vyváženého zaťaženia, nie iba podľa maximálneho počtu uvedeného v katalógu.

Potreby RCF a rýchlosti pre vzorky DNA, RNA a proteínov

Samotné otáčky za minútu nestačia na porovnanie mikrocentrifúg. Rovnaké otáčky za minútu môžu generovať rôzne RCF v závislosti od polomeru rotora. Pri príprave vzoriek DNA, RNA a proteínov by kupujúci mali porovnať požadovanú RCF zo svojej laboratórnej metódy alebo pokynov súpravy s menovitým RCF rotora. Pre jasnejšie vysvetlenie si pozrite RPM vs RCF sprievodca.

Schopnosť vysokej rýchlosti môže byť užitočná na tvorbu peliet, prípravu nukleových kyselín, precipitáciu proteínov a vyčírenie bunkového lyzátu. Vyššia rýchlosť však nie je vždy lepšia. Rúrka, rotor, typ vzorky a laboratórna metóda musia umožňovať zvolenú RCF. Kupujúci, ktorí porovnávajú tieto pracovné postupy, môžu tiež zvážiť a vysokorýchlostná odstredivka,  keď je potrebná väčšia separačná sila.

Tiež by sa malo skontrolovať správanie pri akcelerácii a brzdení. Niektoré pracovné postupy ťažia z rýchlej prevádzky, zatiaľ čo iné môžu vyžadovať miernejšie spomalenie, aby sa predišlo rušivým peletám alebo rozhraniam. Toto je obzvlášť dôležité, keď záleží na regenerácii vzorky a integrite peliet.

 

Mikrocentrifúga v chladničke alebo pri izbovej teplote?

Nie každý pracovný postup mikrocentrifúgy vyžaduje chladenie. Mnoho krátkych úloh s rýchlym odstreďovaním a rutinných separácií malého objemu dokáže zvládnuť model pri izbovej teplote. Rozhodnutie závisí od citlivosti vzorky, trvania cyklu, úrovne RCF, izbovej teploty a laboratórneho SOP.

Vzorky citlivé na teplotu môžu vyžadovať chladenie. RNA, proteíny, enzýmy, bunkové lyzáty a iné citlivé materiály môžu mať prospech z a chladená odstredivka , najmä pri dlhších alebo vyšších otáčkach. Chladenie pomáha udržiavať nižšie prevádzkové podmienky, nemalo by sa však považovať za záruku stability vzorky.

Pred objednaním by kupujúci mali špecifikovať požadovaný teplotný rozsah, typ vzorky, dobu chodu, cieľový RCF, veľkosť trubice a či je potrebné predchladenie. To umožňuje dodávateľovi odporučiť vhodnú chladenú alebo nechladenú konfiguráciu.

Veko rotora, aerosólové riziká a bezpečnosť

Dizajn veka rotora je dôležitým nákupným faktorom. Veko rotora pomáha uchovávať skúmavky počas odstreďovania a môže podporovať bezpečnejšiu prevádzku pri špecifických pracovných postupoch vzoriek. Kupujúci by si mali potvrdiť, či vybraný rotor obsahuje veko a či zodpovedá zamýšľanému typu vzorky.

Pri vzorkách, ktoré môžu vytvárať aerosóly alebo môžu zahŕňať biologické riziko, by kupujúci mali skontrolovať, či sú k dispozícii aerosólovo nepriepustné rotory, utesnené veká rotorov alebo príslušné bezpečnostné príslušenstvo. Laboratórium by malo stále dodržiavať svoje vlastné inštitucionálne pravidlá biologickej bezpečnosti a postupy manipulácie so vzorkami.

Stav trubice je tiež dôležitý. Dobrá mikrocentrifúga nedokáže kompenzovať nevhodné skúmavky. Kupujúci by si mali potvrdiť kvalitu skúmavky, uzáver uzáveru, hodnotenie skúmavky a či výrobca skúmavky povoľuje zamýšľané RCF.

 

Tabuľka výberu mikrocentrifúgy

 

Hluk, stopa a každodenné používanie

Mikrocentrifúgy sú často umiestnené na preplnených laboratórnych laviciach v blízkosti pipiet, vortexových mixérov, zariadení na PCR, stojanov a chladničiek. Kupujúci by si mali pred objednaním skontrolovať pôdorys, priestor na otvorenie veka, vetraciu medzeru a prístup na čistenie.

Hladina hluku je praktická aj v spoločných laboratóriách, učebných laboratóriách a výskumných miestnostiach, kde používatelia obsluhujú viacero prístrojov súčasne. Hluk by nemal nahradiť výkon ako hlavný faktor výberu, ale ovplyvňuje každodennú používateľskú skúsenosť.

Základné bezpečnostné a použiteľné funkcie by mali byť pred nákupom potvrdené. Patrí medzi ne elektrický zámok veka, ochrana proti nevyváženosti, ochrana proti prekročeniu rýchlosti, robustný dizajn komory, možnosti brzdenia a prehľadný displej RPM/RCF.

 

Kontrolný zoznam nákupu pred objednaním

Pred vyžiadaním cenovej ponuky si pripravte nasledujúce informácie:

Ak si nie ste istí, ktorá konfigurácia vyhovuje vášmu pracovnému postupu, pošlite svoj typ vzorky, veľkosť skúmavky, rozmery skúmavky, požadované RCF alebo otáčky za minútu, počet skúmaviek na cyklus, potrebu chladenia, požiadavku veka rotora, napätie a denné pracovné zaťaženie na kontaktujte nás.

 

Záver

Najlepšia mikrocentrifúga na prípravu vzoriek DNA, RNA a proteínov nie je len najrýchlejším alebo najmenším modelom. Mala by zodpovedať veľkosti vašej trubice, kapacite rotora, požiadavke RCF, potrebe chladenia, očakávaniam bezpečnosti a dennému pracovnému zaťaženiu.

Na bežné rýchle odstreďovanie môže stačiť štandardný alebo kompaktný model. Na tvorbu peliet, čírenie lyzátu alebo pracovné postupy s vyššou silou môže byť vhodnejšia vysokorýchlostná mikrocentrifúga. V prípade vzoriek RNA, proteínov, enzýmov alebo vzoriek citlivých na teplotu by sa mala vyhodnotiť možnosť chladenia.

Začnite s typom vzorky a formátom skúmavky, potom pred objednaním potvrďte rotor, adaptér, RCF, chladenie a bezpečnostnú konfiguráciu.

 

 

FAQ

Na čo slúži mikrocentrifúga?

Mikrocentrifúga sa používa na prípravu maloobjemových vzoriek vrátane práce s DNA/RNA, manipulácie s proteínmi, pracovných postupov enzýmov, rýchleho odstreďovania, tvorby peliet a separácie supernatantu.

Aké veľkosti skúmaviek zvyčajne podporuje mikrocentrifúga?

Mnohé mikrocentrifúgy podporujú skúmavky s objemom 1,5 ml a 2 ml. Niektoré modely tiež podporujú 0,2 ml a 0,5 ml skúmavky prostredníctvom adaptérov alebo špeciálnych rotorov. Kompatibilita závisí od konfigurácie rotora a adaptéra.

Potrebujem chladenú mikrocentrifúgu na prácu s RNA alebo proteínmi?

Chladenie môže byť užitočné pre vzorky citlivé na teplotu alebo dlhšie cykly. Konečný výber by sa mal riadiť požiadavkami na vzorku, laboratórnym SOP, trvaním cyklu a cieľovým RCF.

Stačí minicentrifúga na prípravu DNA alebo RNA?

Mini odstredivka je užitočná na rýchle odstreďovanie a jednoduché úlohy s malým objemom. Vysokorýchlostná mikrocentrifúga je zvyčajne lepšia, keď sa vyžaduje silnejší RCF, ovládanie rotora a rutinné opakované použitie.

Mám porovnávať mikrocentrifúgy podľa RPM alebo RCF?

RCF je zvyčajne užitočnejšie, pretože otáčky za minútu závisia od polomeru rotora. Kupujúci by si mali porovnať požadované RCF s menovitým RCF rotora.