Průvodce nákupem mikrocentrifugy pro přípravu vzorků DNA, RNA a proteinů

Výběr mikrocentrifugy není jen o nákupu malé odstředivky s vysokou rychlostí. Pro přípravu DNA, RNA, proteinu, enzymu a buněčného lyzátu závisí správná volba na kompatibilitě zkumavek, rozsahu RCF, kapacitě rotoru, konstrukci víka rotoru, potřebě chlazení, bezpečnostních funkcích a denním objemu vzorku.

Tato příručka pomáhá molekulárně biologickým laboratořím, biochemickým laboratořím, univerzitním výzkumným týmům a distributorům porovnávat možnosti mikrocentrifugy  pro zkumavky 0,2 ml, 0,5 ml, 1,5 ml a 2 ml. Cílem je pomoci kupujícím vybrat praktickou konfiguraci pro přípravu malého objemu vzorků namísto výběru pouze podle RPM nebo ceny.

K čemu slouží mikrocentrifuga?

Pro maloobjemové laboratorní vzorky je určena mikrocentrifuga. Běžně se používá při přípravě DNA/RNA, precipitaci proteinů, manipulaci s enzymy, čiření buněčného lyzátu, rychlém odstředění, tvorbě pelet a separaci supernatantu. V těchto pracovních postupech jsou vzorky obvykle umístěny do mikrozkumavek o objemu 0,2 ml, 0,5 ml, 1,5 ml nebo 2 ml.

Různé typy vzorků vyžadují různé priority nákupu. Uživatelé DNA a RNA se často zaměřují na čistou manipulaci, kompatibilitu zkumavek, rychlé odstřeďování a kontrolu kontaminace. Uživatelé bílkovin a enzymů se mohou více zajímat o tvorbu tepla, chování při brzdění a citlivost vzorku. Pracovní postupy buněčného lyzátu mohou vyžadovat silnější RCF pro čiření nebo tvorbu pelet.

Mikrocentrifugu je také třeba odlišit od minicentrifugy. Minicentrifuga je užitečná pro jednoduché úkoly rychlého odstředění. Vysokorychlostní mikrocentrifuga je vhodnější, když laboratoř potřebuje vyšší RCF, silnější řízení rotoru, lepší opakovatelnost nebo konzistentnější rutinní použití.

 

Kompatibilita zkumavek: 0,2 ml, 0,5 ml, 1,5 ml a 2 ml

Pro většinu pracovních postupů molekulární biologie jsou standardním výchozím bodem zkumavky o objemu 1,5 ml a 2 ml. Kupující by si měli ověřit, zda rotor přímo podporuje tyto trubice a zda značka trubice, styl uzávěru, výška trubice a jmenovité RCF odpovídají zamýšlenému použití.

Menší zkumavky, jako jsou 0,2 ml zkumavky PCR a 0,5 ml zkumavky, mohou vyžadovat adaptéry nebo speciální polohy rotoru. Rotor navržený pro 1,5ml a 2ml zkumavky ne vždy podporuje zkumavky PCR nebo stripy. Pokud laboratoř používá více velikostí trubek, měly by být všechny požadované adaptéry před objednáním potvrzeny.

Kapacita rotoru by měla odpovídat skutečné zátěži. Malá univerzitní laboratoř může potřebovat pouze kompaktní 12místný rotor. Vytížená laboratoř molekulární biologie může potřebovat možnosti s 18 místy, 24 místy nebo s vyšší kapacitou. Kapacita by se měla vypočítat podle použitelného vyváženého zatížení, nikoli pouze podle maximálního počtu uvedeného v katalogu.

Potřeby RCF a rychlosti pro vzorky DNA, RNA a proteinů

Samotné otáčky za minutu pro srovnání mikrocentrifugy nestačí. Stejné otáčky za minutu mohou generovat různé RCF v závislosti na poloměru rotoru. Pro přípravu vzorků DNA, RNA a proteinů by kupující měli porovnat požadovaný RCF z jejich laboratorní metody nebo pokynů k soupravě s jmenovitým RCF rotoru. Pro jasnější vysvětlení viz RPM vs RCF průvodce.

Vysokorychlostní schopnost může být užitečná pro tvorbu pelet, přípravu nukleových kyselin, precipitaci proteinů a čiření buněčného lyzátu. Vyšší rychlost však není vždy lepší. Zkumavka, rotor, typ vzorku a laboratorní metoda musí umožňovat zvolenou RCF. Kupující, kteří porovnávají tyto pracovní postupy, mohou také zvážit: vysokorychlostní odstředivka,  když je vyžadována silnější separační síla.

Mělo by se také zkontrolovat chování zrychlení a brzdění. Některé pracovní postupy těží z rychlého provozu, zatímco jiné mohou vyžadovat mírnější zpomalení, aby se zabránilo rušivým peletám nebo rozhraním. To je zvláště důležité, když záleží na regeneraci vzorku a integritě pelet.

 

Mikrocentrifuga s chlazením nebo při pokojové teplotě?

Ne každý pracovní postup mikrocentrifugy vyžaduje chlazení. Mnoho krátkých úloh s rychlým odstřeďováním a rutinních maloobjemových separací lze zvládnout pomocí modelu při pokojové teplotě. Rozhodnutí závisí na citlivosti vzorku, délce cyklu, úrovni RCF, pokojové teplotě a laboratorním SOP.

Vzorky citlivé na teplotu mohou vyžadovat chlazení. RNA, proteiny, enzymy, buněčné lyzáty a další citlivé materiály mohou mít prospěch z a chlazené odstředivky , zejména při delších nebo vyšších otáčkách. Chlazení pomáhá udržovat nižší provozní podmínky, ale nemělo by být považováno za záruku stability vzorku.

Před objednáním by kupující měli specifikovat požadovaný teplotní rozsah, typ vzorku, dobu běhu, cílovou RCF, velikost trubice a zda je nutné předchlazení. To umožňuje dodavateli doporučit vhodnou chlazenou nebo nechlazenou konfiguraci.

Víko rotoru, aerosolové riziko a bezpečnost

Konstrukce víka rotoru je důležitým nákupním faktorem. Víko rotoru pomáhá obsahovat zkumavky během odstřeďování a může podporovat bezpečnější provoz ve specifických pracovních postupech vzorků. Kupující by si měli ověřit, zda vybraný rotor obsahuje víko a zda odpovídá zamýšlenému typu vzorku.

U vzorků, které mohou vytvářet aerosoly nebo mohou zahrnovat biologické riziko, by si kupující měli ověřit, zda jsou k dispozici aerosolotěsné rotory, utěsněná víka rotorů nebo příslušné bezpečnostní příslušenství. Laboratoř by měla stále dodržovat svá vlastní institucionální pravidla biologické bezpečnosti a postupy pro manipulaci se vzorky.

Důležitý je také stav trubky. Dobrá mikrocentrifuga nemůže kompenzovat nevhodné zkumavky. Kupující by si měli ověřit kvalitu zkumavky, uzávěr uzávěru, hodnocení zkumavky a to, zda výrobce zkumavky povoluje zamýšlené RCF.

 

Tabulka výběru mikrocentrifugy

 

Hluk, stopa a každodenní použití

Mikrocentrifugy jsou často umístěny na přeplněných laboratorních stolech poblíž pipet, vortexových mixérů, PCR zařízení, stojanů a ledniček. Kupující by měli před objednáním zkontrolovat půdorys, prostor pro otevírání víka, ventilační mezeru a přístup k čištění.

Hladina hluku je také praktická ve sdílených laboratořích, výukových laboratořích a výzkumných místnostech, kde uživatelé obsluhují více přístrojů současně. Hluk by neměl nahrazovat výkon jako hlavní faktor výběru, ale ovlivňuje každodenní uživatelský zážitek.

Před nákupem by měly být potvrzeny základní bezpečnostní a použitelné funkce. Patří mezi ně elektrický zámek víka, ochrana proti nevyváženosti, ochrana proti překročení rychlosti, robustní konstrukce komory, možnosti brzdění a přehledný displej RPM/RCF.

 

Kontrolní seznam nákupu před objednávkou

Než požádáte o cenovou nabídku, připravte si následující informace:

Pokud si nejste jisti, která konfigurace vyhovuje vašemu pracovnímu postupu, zašlete typ vzorku, velikost zkumavky, rozměry zkumavky, požadovaný RCF nebo RPM, počet zkumavek na běh, potřebu chlazení, požadavek na víko rotoru, napětí a denní pracovní zátěž na kontaktujte nás.

 

Závěr

Nejlepší mikrocentrifuga pro přípravu vzorků DNA, RNA a proteinů není pouze nejrychlejší nebo nejmenší model. Měla by odpovídat velikosti vaší trubky, kapacitě rotoru, požadavku RCF, potřebě chlazení, očekáváním bezpečnosti a dennímu pracovnímu zatížení.

Pro rutinní rychlou rotaci může stačit standardní nebo kompaktní model. Pro tvorbu pelet, čiření lyzátu nebo pracovní postupy s vyšší silou může být vhodnější vysokorychlostní mikrocentrifuga. U RNA, proteinů, enzymů nebo vzorků citlivých na teplotu by měla být vyhodnocena možnost chlazení.

Začněte s typem vzorku a formátem zkumavky, poté před objednáním potvrďte rotor, adaptér, RCF, chlazení a bezpečnostní konfiguraci.

 

 

FAQ

K čemu slouží mikrocentrifuga?

Mikrocentrifuga se používá pro přípravu malých objemů vzorků, včetně práce s DNA/RNA, manipulace s proteiny, pracovních postupů enzymů, rychlého odstředění, tvorby pelet a separace supernatantu.

Jaké velikosti zkumavek obvykle podporuje mikrocentrifuga?

Mnoho mikrocentrifug podporuje zkumavky o objemu 1,5 ml a 2 ml. Některé modely také podporují zkumavky 0,2 ml a 0,5 ml prostřednictvím adaptérů nebo speciálních rotorů. Kompatibilita závisí na konfiguraci rotoru a adaptéru.

Potřebuji chlazenou mikrocentrifugu pro práci s RNA nebo proteiny?

Chlazení může být užitečné pro vzorky citlivé na teplotu nebo delší běhy. Konečná volba by se měla řídit požadavky na vzorek, laboratorní SOP, trvání cyklu a cílovou RCF.

Stačí minicentrifuga pro přípravu DNA nebo RNA?

Minicentrifuga je užitečná pro rychlé odstřeďování a jednoduché maloobjemové úkoly. Vysokorychlostní mikrocentrifuga je obvykle lepší, když je vyžadováno silnější RCF, ovládání rotoru a rutinní opakované použití.

Mám porovnávat mikrocentrifugy podle RPM nebo RCF?

RCF je obvykle užitečnější, protože otáčky závisí na poloměru rotoru. Kupující by měli porovnat požadovaný RCF s jmenovitým RCF rotoru.