Водич за куповину микроцентрифуге за припрему узорака ДНК, РНК и протеина

Избор микроцентрифуге није само куповина мале центрифуге са великом брзином. За припрему ДНК, РНК, протеина, ензима и ћелијског лизата, прави избор зависи од компатибилности епрувета, опсега РЦФ, капацитета ротора, дизајна поклопца ротора, потребе за хлађењем, безбедносних карактеристика и дневне запремине узорка.

Овај водич помаже лабораторијама молекуларне биологије, биохемијским лабораторијама, универзитетским истраживачким тимовима и дистрибутерима да упореде опције микро центрифуге  за епрувете од 0,2 мл, 0,5 мл, 1,5 мл и 2 мл. Циљ је помоћи купцима да изаберу практичну конфигурацију за припрему узорака мале запремине уместо да бирају само по броју обртаја или цени.

За шта се користи микроцентрифуга?

Микроцентрифуга је дизајнирана за лабораторијске узорке мале запремине. Обично се користи у припреми ДНК/РНА, преципитацији протеина, руковању ензимима, бистрењу ћелијског лизата, брзом окретању, формирању пелета и одвајању супернатанта. У овим радним токовима, узорци се обично стављају у микроепрувете од 0,2мл, 0,5мл, 1,5мл или 2мл.

Различити типови узорака захтевају различите приоритете куповине. Корисници ДНК и РНК се често фокусирају на чисто руковање, компатибилност епрувета, брзо окретање и контролу контаминације. Корисници протеина и ензима могу више бринути о стварању топлоте, понашању при кочењу и осетљивости узорка. Радни ток ћелијског лизата може захтевати јачи РЦФ за бистрење или формирање пелета.

Микроцентрифугу такође треба разликовати од мини центрифуге. Мини центрифуга је корисна за једноставне задатке брзог окретања. Микроцентрифуга велике брзине је прикладнија када је лабораторији потребан већи РЦФ, јача контрола ротора, боља поновљивост или доследнија рутинска употреба.

 

Компатибилност туба: 0,2 мл, 0,5 мл, 1,5 мл и 2 мл

За већину токова молекуларне биологије стандардна полазна тачка су епрувете од 1,5 мл и 2 мл. Купци треба да потврде да ли ротор директно подржава ове цеви и да ли марка цеви, стил поклопца, висина цеви и оцењени РЦФ одговарају намераваној употреби.

За мање епрувете, као што су 0,2 мл ПЦР епрувете и епрувете од 0,5 мл, могу бити потребни адаптери или посебни положаји ротора. Ротор дизајниран за епрувете од 1,5 мл и 2 мл не подржава увек ПЦР епрувете или траке. Ако лабораторија користи више величина цеви, све потребне адаптере треба потврдити пре наручивања.

Капацитет ротора треба да одговара стварном радном оптерећењу. Малој универзитетској лабораторији можда треба само компактни ротор са 12 места. Заузетој лабораторији за молекуларну биологију можда ће бити потребне опције са 18, 24 места или са већим капацитетом. Капацитет треба израчунати према употребљивом балансираном оптерећењу, а не само према максималном броју приказаном у каталогу.

РЦФ и потребе за брзином за узорке ДНК, РНК и протеина

Само број обртаја у минути није довољан за поређење микроцентрифуга. Исти број обртаја може да генерише различите РЦФ у зависности од радијуса ротора. За припрему узорака ДНК, РНК и протеина, купци треба да упореде захтевани РЦФ из својих лабораторијских метода или упутстава за комплет са РЦФ оцењеним на ротору. За јасније објашњење, погледајте РПМ вс РЦФ водич.

Могућност велике брзине може бити корисна за формирање пелета, припрему нуклеинске киселине, преципитацију протеина и бистрење ћелијског лизата. Међутим, већа брзина није увек боља. Цев, ротор, тип узорка и лабораторијска метода морају да дозвољавају изабрани РЦФ. Купци који упоређују ове токове рада могу такође размотрити а центрифуга велике брзине  када је потребна јача сила раздвајања.

Такође треба проверити понашање при убрзању и кочењу. Неки токови посла имају користи од брзог рада, док други могу захтевати нежније успоравање како би се избегло ометање пелета или интерфејса. Ово је посебно важно када су обнављање узорка и интегритет пелета важни.

 

Расхладна микроцентрифуга или микроцентрифуга на собној температури?

Не захтева сваки ток рада микроцентрифуге хлађење. Многи кратки задаци брзог окретања и рутинска одвајања мале запремине могу се носити са моделом на собној температури. Одлука зависи од осетљивости узорка, трајања рада, нивоа РЦФ, собне температуре и лабораторијског СОП-а.

Узорци осетљиви на температуру могу захтевати хлађење. РНК, протеини, ензими, ћелијски лизати и други осетљиви материјали могу имати користи од расхладна центрифуга , посебно током дужих или већих брзина. Хлађење помаже у одржавању нижих радних услова, али га не треба третирати као гаранцију стабилности узорка.

Пре наручивања, купци треба да наведу жељени температурни опсег, тип узорка, време рада, циљни РЦФ, величину цеви и да ли је потребно претходно хлађење. Ово омогућава добављачу да препоручи одговарајућу хлађену или нехлађену конфигурацију.

Поклопац ротора, ризик од аеросола и безбедност

Дизајн поклопца ротора је важан фактор куповине. Поклопац ротора помаже у задржавању епрувета током центрифугирања и може подржати безбеднији рад у одређеним радним токовима узорка. Купци треба да потврде да ли одабрани ротор укључује поклопац и да ли одговара предвиђеном типу узорка.

За узорке који могу да генеришу аеросол или укључују биолошки ризик, купци треба да провере да ли су доступни ротори непропусни за аеросол, запечаћени поклопци ротора или релевантни безбедносни додаци. Лабораторија и даље треба да поштује своја институционална правила о биолошкој безбедности и процедуре руковања узорцима.

Стање цеви је такође важно. Добра микроцентрифуга не може да надокнади неодговарајуће епрувете. Купци треба да потврде квалитет цеви, затварање поклопца, оцену цеви и да ли произвођач цеви дозвољава предвиђени РЦФ.

 

Табела за одабир микроцентрифуга

 

Бука, отисак и свакодневна употреба

Микроцентрифуге се често постављају на препуне лабораторијске клупе у близини пипета, вортекс миксера, ПЦР опреме, регала и фрижидера. Купци треба да провере отисак, простор за отварање поклопца, простор за вентилацију и приступ чишћењу пре наручивања.

Ниво буке је такође практичан у заједничким лабораторијама, наставним лабораторијама и истраживачким просторијама где корисници истовремено користе више инструмената. Бука не би требало да замени перформансе као главни фактор избора, али утиче на свакодневно корисничко искуство.

Основне карактеристике безбедности и употребљивости треба да буду потврђене пре куповине. То укључује електрично закључавање поклопца, заштиту од неравнотеже, заштиту од прекорачења брзине, чврст дизајн коморе, опције кочења и јасан РПМ/РЦФ приказ.

 

Контролна листа за куповину пре наручивања

Пре него што затражите понуду, припремите следеће информације:

Ако нисте сигурни која конфигурација одговара вашем току рада, пошаљите свој тип узорка, величину цеви, димензије цеви, потребан РЦФ или РПМ, број цеви по вожњи, потребу за хлађењем, захтев за поклопац ротора, напон и дневно оптерећење на контактирајте нас.

 

Закључак

Најбоља микроцентрифуга за припрему узорака ДНК, РНК и протеина није само најбржи или најмањи модел. Требало би да одговара величини ваше цеви, капацитету ротора, захтевима за РЦФ, потребама за хлађењем, безбедносним очекивањима и дневном оптерећењу.

За рутинско брзо окретање, стандардни или компактни модел може бити довољан. За формирање пелета, бистрење лизата или радне токове веће силе, микроцентрифуга велике брзине може бити прикладнија. За РНК, протеине, ензиме или узорке осетљиве на температуру, треба проценити опцију у фрижидеру.

Почните са типом узорка и форматом цеви, а затим потврдите ротор, адаптер, РЦФ, хлађење и безбедносну конфигурацију пре наручивања.

 

 

ФАК

За шта се користи микроцентрифуга?

Микроцентрифуга се користи за припрему узорака мале запремине, укључујући рад ДНК/РНА, руковање протеинима, радни ток ензима, брзо окретање, формирање пелета и одвајање супернатанта.

Које величине цеви обично подржава микроцентрифуга?

Многе микроцентрифуге подржавају епрувете од 1,5 мл и 2 мл. Неки модели такође подржавају епрувете од 0,2 мл и 0,5 мл преко адаптера или специјалних ротора. Компатибилност зависи од конфигурације ротора и адаптера.

Да ли ми је потребна микроцентрифуга у фрижидеру за рад са РНК или протеинима?

Хлађење може бити корисно за узорке осетљиве на температуру или дуже серије. Коначни избор треба да прати захтеве узорка, лабораторијски СОП, трајање рада и циљни РЦФ.

Да ли је мини центрифуга довољна за припрему ДНК или РНК?

Мини центрифуга је корисна за брзо окретање и једноставне задатке мале запремине. Микроцентрифуга велике брзине је обично боља када су потребни јачи РЦФ, контрола ротора и рутинска поновљена употреба.

Да ли треба да упоредим микроцентрифуге по РПМ или РЦФ?

РЦФ је обично кориснији јер број обртаја зависи од радијуса ротора. Купци би требало да упореде тражени РЦФ са оцењеним РЦФ ротора.