Poradnik zakupu mikrowirówki do przygotowywania próbek DNA, RNA i białek

Wybór mikrowirówki to nie tylko zakup małej wirówki o dużej prędkości. W przypadku przygotowywania DNA, RNA, białek, enzymów i lizatów komórkowych właściwy wybór zależy od kompatybilności probówek, zakresu RCF, pojemności rotora, konstrukcji pokrywy rotora, potrzeby chłodzenia, zabezpieczeń i dziennej objętości próbki.

Ten przewodnik pomaga laboratoriom biologii molekularnej, laboratoriom biochemii, uniwersyteckim zespołom badawczym i dystrybutorom w porównywaniu opcje mikrowirówek  do probówek 0,2 ml, 0,5 ml, 1,5 ml i 2 ml. Celem jest pomoc kupującym w wyborze praktycznej konfiguracji do przygotowywania próbek w małych objętościach, zamiast wybierać wyłącznie na podstawie obrotów lub ceny.

Do czego służy mikrowirówka?

Mikrowirówka przeznaczona jest do próbek laboratoryjnych o małej objętości. Jest powszechnie stosowany w przygotowaniu DNA/RNA, wytrącaniu białek, obróbce enzymów, klarowaniu lizatów komórkowych, szybkim wirowaniu, tworzeniu osadów i oddzielaniu supernatantu. W tych procesach próbki zwykle umieszcza się w mikroprobówkach o pojemności 0,2 ml, 0,5 ml, 1,5 ml lub 2 ml.

Różne typy próbek wymagają różnych priorytetów zakupowych. Użytkownicy DNA i RNA często skupiają się na czystym użytkowaniu, kompatybilności probówek, szybkim wirowaniu i kontroli zanieczyszczeń. Użytkownicy białek i enzymów mogą bardziej zwracać uwagę na wytwarzanie ciepła, zachowanie podczas hamowania i czułość próbki. Przepływ pracy z lizatem komórkowym może wymagać silniejszego RCF w celu klarowania lub utworzenia osadu.

Mikrowirówkę należy również odróżnić od miniwirówki. Miniwirówka jest przydatna do prostych, szybkich zadań wirowania. Mikrowirówka o dużej prędkości jest bardziej odpowiednia, gdy laboratorium wymaga wyższego współczynnika RCF, silniejszej kontroli rotora, lepszej powtarzalności lub bardziej spójnego rutynowego stosowania.

 

Kompatybilność z tubkami: 0,2 ml, 0,5 ml, 1,5 ml i 2 ml

W przypadku większości prac z zakresu biologii molekularnej standardowym punktem wyjścia są probówki o pojemności 1,5 ml i 2 ml. Kupujący powinni potwierdzić, czy rotor obsługuje bezpośrednio te probówki i czy marka probówki, rodzaj zatyczki, wysokość probówki i znamionowy RCF odpowiadają zamierzonemu zastosowaniu.

Mniejsze probówki, takie jak probówki do PCR 0,2 ml i probówki 0,5 ml, mogą wymagać adapterów lub specjalnych pozycji rotora. Rotor przeznaczony do probówek o pojemności 1,5 ml i 2 ml nie zawsze obsługuje probówki do PCR lub probówki w paskach. Jeśli laboratorium korzysta z probówek o różnych rozmiarach, przed złożeniem zamówienia należy potwierdzić wszystkie wymagane adaptery.

Wydajność rotora powinna odpowiadać rzeczywistemu obciążeniu. Małe laboratorium uniwersyteckie może potrzebować jedynie kompaktowego 12-miejscowego rotora. Zapracowane laboratorium biologii molekularnej może potrzebować opcji na 18, 24 miejsca lub o większej pojemności. Pojemność należy obliczać na podstawie użytecznego, zrównoważonego obciążenia, a nie tylko na podstawie maksymalnej liczby wskazanej w katalogu.

Potrzeby RCF i szybkości dla próbek DNA, RNA i białek

Same obroty nie wystarczą do porównania mikrowirówek. Te same obroty mogą generować różne RCF w zależności od promienia wirnika. W przypadku przygotowania próbek DNA, RNA i białek kupujący powinni porównać wymagany RCF wymagany na podstawie metody laboratoryjnej lub instrukcji zestawu z znamionowym współczynnikiem RCF rotora. Bardziej przejrzyste wyjaśnienie można znaleźć w pkt Przewodnik dotyczący RPM i RCF.

Możliwość dużej prędkości może być przydatna do tworzenia peletek, przygotowywania kwasów nukleinowych, wytrącania białek i klarowania lizatów komórkowych. Jednak większa prędkość nie zawsze jest lepsza. Probówka, rotor, typ próbki i metoda laboratoryjna muszą umożliwiać wybór wybranego RCF. Kupujący porównujący te przepływy pracy mogą również rozważyć: wirówka wysokoobrotowa,  gdy wymagana jest większa siła separacji.

Należy również sprawdzić zachowanie podczas przyspieszania i hamowania. Niektóre przepływy pracy korzystają z szybkiego działania, podczas gdy inne mogą wymagać delikatniejszego zwalniania, aby uniknąć zakłócania granulek lub interfejsów. Jest to szczególnie ważne, gdy liczy się odzysk próbki i integralność peletek.

 

Mikrowirówka z chłodzeniem czy w temperaturze pokojowej?

Nie każdy proces pracy w mikrowirówce wymaga chłodzenia. Wiele krótkich zadań związanych z szybkim wirowaniem i rutynowe separacje małych objętości można obsłużyć za pomocą modelu działającego w temperaturze pokojowej. Decyzja zależy od czułości próbki, czasu trwania analizy, poziomu RCF, temperatury pokojowej i SOP laboratorium.

Próbki wrażliwe na temperaturę mogą wymagać chłodzenia. RNA, białka, enzymy, lizaty komórkowe i inne wrażliwe materiały mogą odnieść korzyści z a wirówka z chłodzeniem , szczególnie podczas dłuższych lub większych prędkości. Chłodzenie pomaga w utrzymaniu niższych warunków pracy, ale nie należy go traktować jako gwarancji stabilności próbki.

Przed złożeniem zamówienia kupujący powinni określić żądany zakres temperatur, typ próbki, czas trwania, docelowy RCF, rozmiar probówki oraz to, czy potrzebne jest wstępne chłodzenie. Dzięki temu dostawca może zalecić odpowiednią konfigurację z chłodzeniem lub bez chłodzenia.

Pokrywa rotora, ryzyko i bezpieczeństwo związane z aerozolami

Konstrukcja pokrywy wirnika jest ważnym czynnikiem przy zakupie. Pokrywa rotora pomaga utrzymać probówki podczas wirowania i może zapewnić bezpieczniejszą pracę w określonych procesach pracy z próbkami. Kupujący powinni potwierdzić, czy wybrany rotor zawiera pokrywę i czy pasuje do zamierzonego rodzaju próbki.

W przypadku próbek, które mogą wytwarzać aerozole lub stwarzać ryzyko biologiczne, kupujący powinni sprawdzić, czy dostępne są rotory aerozoloszczelne, uszczelnione pokrywy rotorów lub odpowiednie akcesoria zabezpieczające. Laboratorium powinno nadal przestrzegać własnych instytucjonalnych zasad bezpieczeństwa biologicznego i procedur postępowania z próbkami.

Stan rur również ma znaczenie. Dobra mikrowirówka nie jest w stanie zrekompensować nieodpowiednich probówek. Kupujący powinni potwierdzić jakość tuby, zamknięcie zatyczki, parametry tuby i to, czy producent tuby dopuszcza zamierzony RCF.

 

Tabela doboru mikrowirówek

 

Hałas, ślad i codzienne użytkowanie

Mikrowirówki często umieszcza się na zatłoczonych stołach laboratoryjnych w pobliżu pipet, mieszadeł wirowych, sprzętu do PCR, stojaków i lodówek. Przed złożeniem zamówienia kupujący powinni sprawdzić wymiary, przestrzeń otwierania pokrywy, prześwit wentylacyjny i dostęp do czyszczenia.

Poziom hałasu jest również praktyczny we wspólnych laboratoriach, laboratoriach dydaktycznych i pomieszczeniach badawczych, w których użytkownicy obsługują wiele instrumentów jednocześnie. Hałas nie powinien zastępować wydajności jako głównego czynnika wyboru, ale wpływa na codzienne wrażenia użytkownika.

Podstawowe funkcje bezpieczeństwa i użyteczności należy potwierdzić przed zakupem. Należą do nich elektryczna blokada pokrywy, zabezpieczenie przed niewyważeniem, zabezpieczenie przed nadmierną prędkością, solidna konstrukcja komory, opcje hamowania i wyraźny wyświetlacz obrotów/RCF.

 

Lista kontrolna zakupów przed złożeniem zamówienia

Przed złożeniem zapytania o wycenę przygotuj następujące informacje:

Jeśli nie masz pewności, która konfiguracja pasuje do Twojego przepływu pracy, wyślij typ próbki, rozmiar probówki, wymiary probówki, wymagany RCF lub RPM, liczbę probówek na cykl, potrzebę chłodzenia, wymagania dotyczące pokrywy rotora, napięcie i dzienne obciążenie pracą do skontaktuj się z nami.

 

Wniosek

Najlepsza mikrowirówka do przygotowania próbek DNA, RNA i białek to nie tylko najszybszy i najmniejszy model. Powinien odpowiadać rozmiarowi probówki, pojemności rotora, wymaganiom RCF, potrzebom chłodzenia, oczekiwaniom w zakresie bezpieczeństwa i codziennemu obciążeniu pracą.

Do rutynowego szybkiego zwalniania może wystarczyć model standardowy lub kompaktowy. W przypadku tworzenia peletek, klarowania lizatu lub procesów wymagających większej siły bardziej odpowiednia może być mikrowirówka o dużej prędkości. W przypadku RNA, białek, enzymów lub próbek wrażliwych na temperaturę należy rozważyć opcję przechowywania w lodówce.

Zacznij od typu próbki i formatu probówki, a następnie przed złożeniem zamówienia potwierdź konfigurację rotora, adaptera, RCF, chłodzenia i bezpieczeństwa.

 

 

Często zadawane pytania

Do czego służy mikrowirówka?

Mikrowirówkę stosuje się do przygotowania próbek o małej objętości, w tym do obróbki DNA/RNA, obróbki białek, przepływu enzymów, szybkiego wirowania, tworzenia osadów i oddzielania supernatantu.

Jakie rozmiary probówek zwykle obsługuje mikrowirówka?

Wiele mikrowirówek obsługuje probówki o pojemności 1,5 ml i 2 ml. Niektóre modele obsługują także probówki 0,2 ml i 0,5 ml poprzez adaptery lub specjalne rotory. Kompatybilność zależy od konfiguracji rotora i adaptera.

Czy do pracy z RNA lub białkami potrzebuję mikrowirówki z chłodzeniem?

Chłodzenie może być przydatne w przypadku próbek wrażliwych na temperaturę lub dłuższych serii. Ostateczny wybór powinien uwzględniać wymagania dotyczące próbki, SOP laboratorium, czas trwania badania i docelowy RCF.

Czy do przygotowania DNA lub RNA wystarczy miniwirówka?

Miniwirówka jest przydatna do szybkiego wirowania i prostych zadań związanych z małą objętością. Mikrowirówka o dużej prędkości jest zwykle lepsza, gdy wymagane jest silniejsze RCF, kontrola rotora i rutynowe powtarzanie.

Czy powinienem porównywać mikrowirówki według RPM czy RCF?

RCF jest zwykle bardziej przydatny, ponieważ prędkość obrotowa zależy od promienia wirnika. Kupujący powinni porównać wymagany RCF z znamionowym RCF wirnika.