Guida all'acquisto di microcentrifuga per la preparazione di campioni di DNA, RNA e proteine

Scegliere una microcentrifuga non significa solo acquistare una piccola centrifuga ad alta velocità. Per la preparazione di DNA, RNA, proteine, enzimi e lisati cellulari, la scelta giusta dipende dalla compatibilità delle provette, dalla gamma RCF, dalla capacità del rotore, dal design del coperchio del rotore, dalla necessità di raffreddamento, dalle caratteristiche di sicurezza e dal volume giornaliero del campione.

Questa guida aiuta i laboratori di biologia molecolare, i laboratori di biochimica, i gruppi di ricerca universitari e i distributori a effettuare confronti opzioni di microcentrifuga  per provette da 0,2 ml, 0,5 ml, 1,5 ml e 2 ml. L'obiettivo è aiutare gli acquirenti a scegliere una configurazione pratica per la preparazione di campioni di piccoli volumi invece di scegliere solo in base al numero di giri o al prezzo.

A cosa serve una microcentrifuga?

Una microcentrifuga è progettata per campioni di laboratorio di piccolo volume. È comunemente usato nella preparazione del DNA/RNA, nella precipitazione delle proteine, nella manipolazione degli enzimi, nella chiarificazione del lisato cellulare, nello spin-down rapido, nella formazione di pellet e nella separazione del surnatante. In questi flussi di lavoro, i campioni vengono solitamente inseriti in microprovette da 0,2 ml, 0,5 ml, 1,5 ml o 2 ml.

Diversi tipi di campioni richiedono diverse priorità di acquisto. Gli utilizzatori di DNA e RNA spesso si concentrano sulla manipolazione pulita, sulla compatibilità delle provette, sulla centrifugazione rapida e sul controllo della contaminazione. Gli utilizzatori di proteine ​​ed enzimi potrebbero preoccuparsi maggiormente della generazione di calore, del comportamento di frenata e della sensibilità del campione. I flussi di lavoro del lisato cellulare possono richiedere RCF più forti per la chiarificazione o la formazione del pellet.

Occorre distinguere anche una microcentrifuga da una minicentrifuga. Una mini centrifuga è utile per semplici attività di centrifugazione rapida. Una microcentrifuga ad alta velocità è più adatta quando il laboratorio necessita di RCF più elevati, controllo più forte del rotore, migliore ripetibilità o uso di routine più coerente.

 

Compatibilità tubo: 0,2 ml, 0,5 ml, 1,5 ml e 2 ml

Per la maggior parte dei flussi di lavoro di biologia molecolare, le provette da 1,5 ml e 2 ml rappresentano il punto di partenza standard. Gli acquirenti devono verificare se il rotore supporta direttamente queste provette e se la marca della provetta, il tipo di tappo, l'altezza della provetta e la RCF nominale corrispondono all'uso previsto.

Le provette più piccole, come le provette per PCR da 0,2 ml e le provette da 0,5 ml, potrebbero richiedere adattatori o posizioni speciali del rotore. Un rotore progettato per provette da 1,5 ml e 2 ml non sempre supporta provette PCR o provette a strisce. Se il laboratorio utilizza provette di diverse dimensioni, tutti gli adattatori necessari devono essere confermati prima dell'ordine.

La capacità del rotore dovrebbe corrispondere al carico di lavoro reale. Un piccolo laboratorio universitario potrebbe aver bisogno solo di un rotore compatto da 12 posti. Un laboratorio di biologia molecolare molto impegnato può necessitare di opzioni da 18 posti, 24 posti o con capacità maggiore. La capacità deve essere calcolata in base al carico bilanciato utilizzabile, non solo in base al numero massimo indicato nel catalogo.

RCF e esigenze di velocità per campioni di DNA, RNA e proteine

Il solo numero di giri non è sufficiente per confrontare le microcentrifughe. Lo stesso numero di giri può generare RCF diversi a seconda del raggio del rotore. Per la preparazione dei campioni di DNA, RNA e proteine, gli acquirenti devono confrontare l'RCF richiesto dal metodo di laboratorio o dalle istruzioni del kit con l'RCF nominale del rotore. Per una spiegazione più chiara fare riferimento al Guida RPM vs RCF.

La capacità ad alta velocità può essere utile per la formazione di pellet, la preparazione dell'acido nucleico, la precipitazione delle proteine ​​e la chiarificazione del lisato cellulare. Tuttavia, una velocità maggiore non è sempre migliore. La provetta, il rotore, il tipo di campione e il metodo di laboratorio devono tutti consentire l'RCF selezionato. Gli acquirenti che confrontano questi flussi di lavoro possono anche prendere in considerazione a centrifuga ad alta velocità  quando è richiesta una forza di separazione maggiore.

Dovrebbero essere controllati anche il comportamento in accelerazione e frenata. Alcuni flussi di lavoro traggono vantaggio da un funzionamento rapido, mentre altri potrebbero richiedere una decelerazione più delicata per evitare di disturbare pellet o interfacce. Ciò è particolarmente importante quando il recupero del campione e l'integrità del pellet sono importanti.

 

Microcentrifuga refrigerata o a temperatura ambiente?

Non tutti i flussi di lavoro delle microcentrifughe richiedono la refrigerazione. Molte attività brevi di centrifugazione rapida e separazioni di routine di piccoli volumi possono essere gestite da un modello a temperatura ambiente. La decisione dipende dalla sensibilità del campione, dalla durata della corsa, dal livello di RCF, dalla temperatura ambiente e dalla SOP del laboratorio.

I campioni sensibili alla temperatura potrebbero richiedere il raffreddamento. RNA, proteine, enzimi, lisati cellulari e altri materiali sensibili possono trarre vantaggio da a centrifuga refrigerata , soprattutto durante i cicli più lunghi o a velocità più elevata. La refrigerazione aiuta a mantenere condizioni operative inferiori, ma non deve essere trattata come una garanzia di stabilità del campione.

Prima di ordinare, gli acquirenti devono specificare l'intervallo di temperatura desiderato, il tipo di campione, il tempo di analisi, l'RCF target, la dimensione del tubo e se è necessario il preraffreddamento. Ciò consente al fornitore di consigliare una configurazione refrigerata o non refrigerata adatta.

Coperchio del rotore, rischio di aerosol e sicurezza

Il design del coperchio del rotore è un importante fattore di acquisto. Un coperchio del rotore aiuta a contenere le provette durante la centrifugazione e può supportare un funzionamento più sicuro in flussi di lavoro di campioni specifici. Gli acquirenti devono verificare se il rotore selezionato include un coperchio e se corrisponde al tipo di campione previsto.

Per i campioni che possono generare aerosol o comportare rischi biologici, gli acquirenti devono verificare se sono disponibili rotori a tenuta di aerosol, coperchi rotore sigillati o relativi accessori di sicurezza. Il laboratorio dovrebbe comunque seguire le proprie regole istituzionali di biosicurezza e le procedure di gestione dei campioni.

Anche le condizioni del tubo sono importanti. Una buona microcentrifuga non può compensare provette inadatte. Gli acquirenti devono confermare la qualità della provetta, la chiusura del tappo, la classificazione della provetta e se il produttore della provetta consente l'RCF previsto.

 

Tabella di selezione della microcentrifuga

 

Rumore, impronta e uso quotidiano

Le microcentrifughe vengono spesso posizionate su banchi di laboratorio affollati vicino a pipette, miscelatori vortex, apparecchiature PCR, rack e frigoriferi. Gli acquirenti devono controllare l'ingombro, lo spazio di apertura del coperchio, lo spazio di ventilazione e l'accesso per la pulizia prima di ordinare.

Il livello di rumore è pratico anche nei laboratori condivisi, nei laboratori didattici e nelle aule di ricerca in cui gli utenti utilizzano più strumenti contemporaneamente. Il rumore non dovrebbe sostituire le prestazioni come principale fattore di selezione, ma influisce sull'esperienza quotidiana dell'utente.

Le funzionalità di base di sicurezza e usabilità devono essere confermate prima dell'acquisto. Questi includono il blocco elettrico del coperchio, la protezione dallo squilibrio, la protezione da velocità eccessiva, il design robusto della camera, le opzioni di frenata e il chiaro display RPM/RCF.

 

Lista di controllo per l'acquisto prima di ordinare

Prima di richiedere un preventivo, preparare le seguenti informazioni:

Se non sei sicuro di quale configurazione sia adatta al tuo flusso di lavoro, invia il tipo di campione, le dimensioni della provetta, le dimensioni della provetta, l'RCF o il numero di giri richiesto, il numero di provette per analisi, la necessità di raffreddamento, i requisiti del coperchio del rotore, la tensione e il carico di lavoro giornaliero a contattaci.

 

Conclusione

La migliore microcentrifuga per la preparazione di campioni di DNA, RNA e proteine ​​non è semplicemente il modello più veloce o più piccolo. Dovrebbe corrispondere alle dimensioni del tubo, alla capacità del rotore, ai requisiti RCF, alle esigenze di raffreddamento, alle aspettative di sicurezza e al carico di lavoro giornaliero.

Per uno spin-down rapido e di routine, un modello standard o compatto può essere sufficiente. Per la formazione di pellet, la chiarificazione del lisato o flussi di lavoro a forza maggiore, una microcentrifuga ad alta velocità può essere più adatta. Per RNA, proteine, enzimi o campioni sensibili alla temperatura, dovrebbe essere valutata un'opzione refrigerata.

Inizia con il tipo di campione e il formato della provetta, quindi conferma la configurazione di rotore, adattatore, RCF, raffreddamento e sicurezza prima di ordinare.

 

 

Domande frequenti

A cosa serve una microcentrifuga?

Una microcentrifuga viene utilizzata per la preparazione di campioni di piccolo volume, compreso il lavoro su DNA/RNA, la manipolazione delle proteine, i flussi di lavoro degli enzimi, lo spin-down rapido, la formazione di pellet e la separazione del surnatante.

Quali dimensioni di tubi supporta solitamente una microcentrifuga?

Molte microcentrifughe supportano provette da 1,5 ml e 2 ml. Alcuni modelli supportano anche provette da 0,2 ml e 0,5 ml tramite adattatori o rotori speciali. La compatibilità dipende dalla configurazione del rotore e dell'adattatore.

Ho bisogno di una microcentrifuga refrigerata per il lavoro su RNA o proteine?

La refrigerazione può essere utile per campioni sensibili alla temperatura o per cicli più lunghi. La scelta finale dovrebbe seguire i requisiti del campione, la SOP del laboratorio, la durata della corsa e l'RCF target.

Una mini centrifuga è sufficiente per la preparazione del DNA o dell'RNA?

Una mini centrifuga è utile per una rapida centrifugazione e per semplici attività di piccolo volume. Una microcentrifuga ad alta velocità è solitamente migliore quando sono richiesti RCF più forti, controllo del rotore e uso ripetuto di routine.

Dovrei confrontare le microcentrifughe per RPM o RCF?

RCF è solitamente più utile perché il numero di giri dipende dal raggio del rotore. Gli acquirenti dovrebbero confrontare l'RCF richiesto con l'RCF nominale del rotore.