Anleitung zur PCR-Plattenzentrifuge: Vorbereitung von 96-Well- und 384-Well-Platten

Eine PCR-Plattenzentrifuge wird für kurze Spin-Down-Schritte in PCR-, qPCR- und molekularbiologischen Arbeitsabläufen mit hohem Durchsatz verwendet. Bei 96-Well- und 384-Well-Platten besteht das Ziel in der Regel nicht in einer starken Trennung, sondern darin, Tröpfchen von den Wellwänden zu sammeln, Blasen zu reduzieren und dabei zu helfen, dass sich die Flüssigkeit am Boden jedes Wells absetzt, bevor sie dem Temperaturwechsel, dem Ablesen, der Lagerung oder der nachgeschalteten Handhabung unterzogen wird.

GlanLab bietet Optionen für Plattenzentrifugen und Mikroplattenzentrifugen für Labore, die eine zuverlässige Plattenvorbereitung benötigen. Bei der Auswahl von a Käufer einer Plattenzentrifuge sollten das Plattenformat, die Versiegelungsmethode, die Auswuchtmethode, den Geschwindigkeits-/RCF-Bereich, die Sicherheitsfunktionen und den täglichen Durchsatz prüfen, anstatt nur nach Geschwindigkeit zu wählen.

 

Warum PCR-Platten zentrifugiert werden müssen

Sammeln von Tröpfchen von Brunnenwänden

Nach dem Pipettieren, Verschließen oder Mischen können kleine Tröpfchen an der Seitenwand jeder Vertiefung oder auf der Verschlussfolie zurückbleiben. Eine PCR-Plattenzentrifuge hilft dabei, diese Tröpfchen durch einen kurzen Spin-Down-Schritt zum Boden der Wells zu bewegen, wodurch die Plattenvorbereitung vor dem nächsten Prozess konsistenter wird.

Reduzierung von Blasen vor der PCR oder qPCR

Nach dem Pipettieren, Mischen oder Verschließen können Blasen entstehen. In PCR- und qPCR-Arbeitsabläufen können sie die Positionierung der Flüssigkeit, die Versiegelungsqualität oder die optische Messung beeinträchtigen. Ein kurzer Zentrifugationsschritt trägt dazu bei, häufige Probleme bei der Handhabung von Flüssigkeiten zu reduzieren, sollte jedoch nicht als Garantie für bessere PCR-Ergebnisse angesehen werden.

Kurzes Schleudern nach dem Mischen oder Versiegeln

Viele Labore führen nach dem Hinzufügen von Reagenzien, dem Mischen von Proben oder dem Anbringen einer Versiegelungsfolie einen kurzen Zentrifugendurchlauf durch. Geschwindigkeit und Zeit sollten nicht von unabhängigen Online-Protokollen kopiert werden. Benutzer sollten die Reagenzanweisungen, die Richtlinien des Plattenherstellers, das Zentrifugenhandbuch und die internen Labor-SOPs befolgen.

 

Unterschiede zwischen 96-Well- und 384-Well-Platten

96-Well-Platten: üblich und einfacher zu handhaben

Eine 96-Well-Platte ist eines der gängigsten Formate in PCR- und qPCR-Laboren. Im Vergleich zu 384-Well-Platten verfügen sie in der Regel über ein größeres Well-Volumen, mehr Platz zum Pipettieren und eine einfachere visuelle Inspektion. Für viele Routinelabore reicht eine 96-Well-Plattenzentrifuge für die tägliche Vorbereitung aus.

384-Well-Platten: kleineres Volumen und höhere Handhabungsempfindlichkeit

Für Arbeitsabläufe mit höherem Durchsatz wird häufig eine 384-Well-Platte verwendet. Da jede Vertiefung ein kleineres Flüssigkeitsvolumen enthält, werden Tröpfchen, Blasen, Versiegelungsqualität und Plattenpositionierung wichtiger. Eine Zentrifuge, die für 96-Well-Platten geeignet ist, passt möglicherweise nicht automatisch für 384-Well-Platten.

Was Käufer vor der Auswahl prüfen sollten

Käufer sollten bestätigen, ob die Zentrifuge 96-Well-Platten, 384-Well-Platten, Platten mit Rand, Platten mit Halbrand, Platten ohne Rand, PCR-Röhrchenstreifen und versiegelte Platten unterstützt. Auch die Beladungsrichtung ist wichtig, da einige Mikroplattenzentrifugen eine vertikale Beladung verwenden, während andere unterschiedliche Rotorstrukturen verwenden.

 

PCR-Streifen, Platten mit und ohne Rand

PCR-Streifen und kleinvolumige Mikroplatten

Einige Labore verwenden 0,2-ml-PCR-Röhrchen, 8-Röhrchen-Streifen oder kleinvolumige Streifenformate anstelle vollständiger PCR-Platten. In diesem Fall sollten Käufer prüfen, ob die Mikroplattenzentrifuge PCR-Streifen direkt unterstützt oder Adapter benötigt.

PCR-Platten mit Rand, Halbrand und ohne Rand

Platten mit Rand, Halbrand und ohne Rand unterscheiden sich in der Rahmenstruktur und der mechanischen Unterstützung. Diese Unterschiede wirken sich darauf aus, wie die Platte in der Zentrifuge sitzt, daher ist ein sicherer Sitz wichtiger als eine allgemeine Behauptung der „PCR-Plattenkompatibilität“.

Plattenadapter und Laderichtung

Für bestimmte Plattentypen oder PCR-Streifen sind möglicherweise Adapter erforderlich. Die Laderichtung beeinflusst auch die Arbeitsgeschwindigkeit und den Bedienkomfort. Eine geeignete PCR-Plattenzentrifuge sollte dem tatsächlich im Labor verwendeten Plattenformat entsprechen und nicht nur dem allgemeinen Kategorienamen.

 

Quick Spin vs. Separationszentrifugation

PCR-Plattenzentrifugen dienen hauptsächlich dem schnellen Zentrifugieren

Eine PCR-Plattenzentrifuge ist hauptsächlich für die kurzzeitige Zentrifugation von Platten konzipiert. Seine übliche Verwendung ist das Sammeln von Tröpfchen, die Reduzierung von Blasen und das Absetzen von Flüssigkeiten. Es unterscheidet sich von einer Zentrifuge, die für Blutröhrchen, große Flaschen oder die Trennung schwerer Proben verwendet wird.

Unterschied zu Standard-Laborzentrifugen

Standardzentrifugen können für Röhrchen, konische Röhrchen, Flaschen, Blutproben oder größere Probenbehälter ausgelegt sein. Im Gegensatz dazu ist eine Mikroplattenzentrifuge auf das Plattenformat und die Bequemlichkeit kurzer Zentrifugen ausgelegt. Käufer vergleichen Laborzentrifugenprodukte  sollten den Bedarf an Plattenvorbereitung und Röhrchentrennung trennen.

Warum Geschwindigkeit nicht der einzige Faktor ist

Geschwindigkeit ist nur eine Spezifikation. Bei der PCR-Plattenvorbereitung spielen auch Beschleunigung, Bremsen, Deckelverriegelung, Unwuchterkennung, Plattensitz, Geräuschpegel und Stellfläche eine Rolle. Ein kompaktes Modell mit korrekter Plattenkompatibilität kann nützlicher sein als ein schnelleres Modell, das nicht auf die Platten des Labors passt.

 

Bedenken hinsichtlich der Plattenbalance und der Versiegelungsfolie

Warum Plattenbalance wichtig ist

PCR-Platten sollten entsprechend dem Zentrifugendesign symmetrisch beladen werden. Wenn nur eine Platte verwendet wird, ist bei einigen Zentrifugen möglicherweise eine Ausgleichsplatte erforderlich. Zur Anleitung dazu Wie man eine 96-Well-Platte zentrifugiert , Gleichgewicht, Versiegelung und Lademethode sollten vor dem routinemäßigen Gebrauch überprüft werden.

Bedenken bezüglich Dichtungsfilm und Undichtigkeiten

Siegelfolie, Klebefolie, Heißsiegel und Deckelstreifen sollten vor der Zentrifugation korrekt angebracht werden. Eine schlechte Abdichtung kann während des Zentrifugierens zu Undichtigkeiten oder Probenverlusten führen. Daher sollten Benutzer prüfen, ob die Platte gleichmäßig abgedichtet ist und ohne Hindernisse in die Kammer passt.

Sicherer Betrieb vor und nach der Zentrifugation

Eine gute PCR-Plattenzentrifuge sollte über eine sichere Deckelkontrolle und einen stabilen Betrieb verfügen. Funktionen wie Deckelverriegelung, Unwuchtwarnung und sanftes Bremsen tragen dazu bei, das Betriebsrisiko zu reduzieren. Benutzer sollten den Sicherheitsschutz nicht umgehen.

Auswahltabelle für Mikrotiterplatten-Zentrifugen

Plattenkompatibilitätstabelle

Checkliste für Käufer

Bestätigen Sie vor der Bestellung das Plattenformat, den Plattentyp, die Dichtungsmethode, die maximale Geschwindigkeit/RCF, die Beschleunigungs- und Bremsleistung, die Auswuchtmethode, die Deckelverriegelung, die Unwuchterkennung, den Geräuschpegel, die Stellfläche, die Spannung, die Steckeranforderung und den Lieferantensupport.

Endgültige Anfragerichtung

Geben Sie bei der Kontaktaufnahme mit einem Lieferanten das Plattenformat, den Plattentyp, die Versiegelungsmethode, den täglichen Durchsatz, die erwartete schnelle Schleuderanforderung, die Spannung und die Einschränkungen des Arbeitsbereichs an. Sie können bei GlanLab eine Zentrifugenempfehlung  basierend auf Ihren PCR-Plattenvorbereitungsanforderungen anfordern.

 

Häufige Fehler bei der Handhabung

Wählen Sie eine Röhrchenzentrifuge anstelle einer Plattenzentrifuge

Röhrchenzentrifugen und Plattenzentrifugen sind für unterschiedliche Probenträger ausgelegt. Eine allgemeine Röhrchenzentrifuge sollte nicht für PCR-Platten verwendet werden, es sei denn, ein kompatibler Plattenrotor ist eindeutig angegeben.

Die Kompatibilität mit 384-Well-Platten oder Platten mit Sockel wird ignoriert

Einige Labore beginnen mit 96-Well-Platten, wechseln aber später zu 384-Well- oder Sockelformaten. Durch die Wahl eines Modells mit breiterer Kompatibilität kann der zukünftige Ersatzbedarf reduziert werden.

Verwendung fester Protokollwerte aus unabhängigen Quellen

Geschwindigkeits- und Zeitwerte sollten aus Reagenzanweisungen, Plattenanleitungen, Zentrifugenhandbüchern und Labor-SOPs stammen. Universelle PCR-Zentrifugationseinstellungen sollten nicht ohne Überprüfung kopiert werden.

 

Abschluss

Eine PCR-Plattenzentrifuge sollte im Hinblick auf Plattenkompatibilität, schnelle Zentrifugierleistung, Gleichgewichtsmethode, Versiegelungssicherheit und Effizienz des täglichen Arbeitsablaufs ausgewählt werden. Für die Vorbereitung von 96-Well- und 384-Well-Platten sollten Käufer das Plattenformat, den Plattentyp, die Versiegelungsmethode, den Geschwindigkeits-/RCF-Bereich, die Sicherheitsmerkmale und den Durchsatz bestätigen, bevor sie sich für ein Modell entscheiden.

GlanLab bietet Plattenzentrifugen- und Mikroplattenzentrifugenlösungen für PCR/qPCR-Labore, molekularbiologische Labore und Probenvorbereitungsabläufe mit hohem Durchsatz. Benutzer können ihr Plattenformat, ihre Versiegelungsmethode, ihre Spannung und ihre täglichen Handhabungsanforderungen mit GlanLab teilen, um eine geeignete Zentrifuge auszuwählen.Kontaktieren Sie uns.

 

FAQ

Wozu dient eine PCR-Plattenzentrifuge?

Es wird hauptsächlich zum schnellen Herunterfahren von PCR-Platten verwendet, um Tröpfchen von den Wellwänden zu sammeln, Blasen zu reduzieren und das Absetzen von Flüssigkeit am Boden der Wells zu unterstützen.

Kann eine PCR-Plattenzentrifuge 96-Well- und 384-Well-Platten verarbeiten?

Einige Modelle unterstützen beide Formate, Käufer müssen jedoch die Kompatibilität mit dem jeweiligen Plattentyp, der Plattenhöhe und der Versiegelungsmethode bestätigen.

Ist eine Mikroplattenzentrifuge dasselbe wie eine Standardzentrifuge?

Nein. Eine Mikroplattenzentrifuge ist für Plattenformate konzipiert, während Standardzentrifugen häufig für Röhrchen, Flaschen oder andere Probenbehälter ausgelegt sind.

Benötige ich eine spezielle Zentrifuge für PCR-Platten mit Sockel?

Die Zentrifuge muss eindeutig Platten mit Rand, Halbrand oder ohne Rand unterstützen. Vor dem Kauf sollten Abstand und Rahmenunterstützung überprüft werden.

Wie soll ich eine 96-Well-Plattenzentrifuge auswählen?

Überprüfen Sie Plattenkompatibilität, Geschwindigkeits-/RCF-Bereich, Auswuchtmethode, Dichtungssicherheit, Beschleunigung/Bremsen, Stellfläche, Geräuschpegel und Lieferantenunterstützung.