Guide de centrifugation de plaques PCR : préparation de plaques à 96 puits et 384 puits

Une centrifugeuse à plaques PCR est utilisée pour de courtes étapes de rotation dans les flux de travail de PCR, de qPCR et de biologie moléculaire à haut débit. Pour les plaques à 96 et 384 puits, l'objectif n'est généralement pas une séparation lourde, mais la collecte des gouttelettes des parois des puits, la réduction des bulles et l'aide au liquide qui se dépose au fond de chaque puits avant le cycle thermique, la lecture, le stockage ou la manipulation en aval.

GlanLab propose des options de centrifugeuse à plaques et de centrifugeuse à microplaques pour les laboratoires qui ont besoin d'une préparation de plaques fiable. Lors de la sélection d'un centrifugeuse à plaques , les acheteurs doivent vérifier le format de la plaque, la méthode de scellage, la méthode d'équilibre, la plage de vitesse/RCF, les caractéristiques de sécurité et le débit quotidien au lieu de choisir uniquement en fonction de la vitesse.

 

Pourquoi les plaques PCR nécessitent une centrifugation

Collecte de gouttelettes sur les parois des puits

Après le pipetage, le scellement ou le mélange, de petites gouttelettes peuvent rester sur la paroi latérale de chaque puits ou sur le film de scellement. Une centrifugeuse à plaques PCR aide à déplacer ces gouttelettes vers le fond des puits via une brève étape de rotation, rendant la préparation des plaques plus cohérente avant le processus suivant.

Réduire les bulles avant PCR ou qPCR

Des bulles peuvent apparaître après le pipetage, le mélange ou le scellement. Dans les flux de travail PCR et qPCR, ils peuvent affecter le positionnement du liquide, la qualité du scellement ou la lecture optique. Une courte étape de centrifugation permet de réduire les problèmes courants de manipulation des liquides, mais elle ne doit pas être décrite comme une garantie de meilleurs résultats de PCR.

Essorage court après mélange ou scellage

De nombreux laboratoires effectuent une courte rotation après avoir ajouté des réactifs, mélangé des échantillons ou appliqué un film de scellement. La vitesse et le temps ne doivent pas être copiés à partir de protocoles en ligne non liés. Les utilisateurs doivent suivre les instructions relatives aux réactifs, les conseils du fabricant de plaques, le manuel de la centrifugeuse et les SOP internes du laboratoire.

 

Différences entre les plaques à 96 puits et à 384 puits

Plaques 96 puits : courantes et plus faciles à manipuler

Une plaque de 96 puits est l’un des formats les plus courants dans les laboratoires PCR et qPCR. Comparé aux plaques à 384 puits, il présente généralement un volume de puits plus grand, un espace de pipetage plus facile et une inspection visuelle plus simple. Pour de nombreux laboratoires de routine, une centrifugeuse à plaques à 96 puits suffit pour la préparation quotidienne.

Plaques 384 puits : volume réduit et sensibilité de manipulation plus élevée

Une plaque de 384 puits est souvent utilisée pour les flux de travail à plus haut débit. Étant donné que chaque puits contient un volume de liquide plus petit, les gouttelettes, les bulles, la qualité de l'étanchéité et le positionnement des plaques deviennent plus importants. Une centrifugeuse adaptée aux plaques à 96 puits peut ne pas s'adapter automatiquement aux plaques à 384 puits.

Ce que les acheteurs doivent vérifier avant de choisir

Les acheteurs doivent confirmer si la centrifugeuse prend en charge les plaques à 96 puits, les plaques à 384 puits, les plaques à jupe, les plaques semi-jupées, les plaques sans jupe, les barrettes de tubes PCR et les plaques scellées. La direction de chargement est également importante car certaines centrifugeuses à microplaques utilisent un chargement vertical, tandis que d'autres utilisent des structures de rotor différentes.

 

Bandelettes PCR, plaques avec et sans jupe

Bandelettes PCR et microplaques petit volume

Certains laboratoires utilisent des tubes PCR de 0,2 ml, des barrettes de 8 tubes ou des formats de barrettes de petit volume au lieu de plaques PCR complètes. Dans ce cas, les acheteurs doivent vérifier si la centrifugeuse pour microplaques prend directement en charge les bandelettes PCR ou nécessite des adaptateurs.

Plaques PCR avec jupe, demi-jupe et sans jupe

Les plaques avec jupe, demi-jupe et sans jupe diffèrent par la structure du cadre et le support mécanique. Ces différences affectent la manière dont la plaque est placée à l'intérieur de la centrifugeuse. Un ajustement sûr est donc plus important qu'une affirmation générale de « compatibilité des plaques PCR ».

Adaptateurs de plaque et sens de chargement

Des adaptateurs peuvent être nécessaires pour des types de plaques ou des bandelettes PCR spécifiques. La direction de chargement affecte également la vitesse et la commodité de fonctionnement. Une centrifugeuse de plaques PCR appropriée doit correspondre au format de plaque réel utilisé dans le laboratoire, et pas seulement au nom général de la catégorie.

 

Centrifugation à rotation rapide ou à séparation

Les centrifugeuses à plaques PCR sont principalement destinées à une rotation rapide

Une centrifugeuse à plaques PCR est principalement conçue pour une brève centrifugation des plaques. Son utilisation courante est la collecte de gouttelettes, la réduction des bulles et la décantation des liquides. Elle est différente d'une centrifugeuse utilisée pour les tubes de sang, les grandes bouteilles ou la séparation d'échantillons lourds.

Différence par rapport aux centrifugeuses de laboratoire standards

Les centrifugeuses standard peuvent être conçues pour des tubes, des tubes coniques, des bouteilles, des échantillons de sang ou des récipients d'échantillons plus grands. En revanche, une centrifugeuse à microplaques est conçue autour du format de plaque et de la commodité d’un essorage court. Acheteurs comparant les produits de centrifugeuse de laboratoire  doivent séparer les besoins de préparation des plaques des besoins de séparation des tubes.

Pourquoi la vitesse n'est pas le seul facteur

La vitesse n’est qu’une spécification. Pour la préparation des plaques PCR, l'accélération, le freinage, le verrouillage du couvercle, la détection de déséquilibre, l'ajustement des plaques, le niveau de bruit et l'encombrement sont également importants. Un modèle compact avec une compatibilité correcte des plaques peut être plus utile qu'un modèle plus rapide qui ne s'adapte pas aux plaques du laboratoire.

 

Problèmes d’équilibre des plaques et de film d’étanchéité

Pourquoi l'équilibre des plaques est important

Les plaques PCR doivent être chargées symétriquement selon la conception de la centrifugeuse. Si une seule plaque est utilisée, certaines centrifugeuses peuvent nécessiter une plaque d'équilibrage. Pour obtenir des conseils sur comment centrifuger une plaque à 96 puits , l'équilibre, l'étanchéité et la méthode de chargement doivent être vérifiés avant une utilisation de routine.

Problèmes de film d’étanchéité et de fuite

Le film d’étanchéité, le film adhésif, les thermoscellages et les bandes de capuchons doivent être appliqués correctement avant la centrifugation. Une mauvaise étanchéité peut entraîner des fuites ou une perte d'échantillon pendant l'essorage. Les utilisateurs doivent donc vérifier si la plaque est scellée uniformément et s'adapte à la chambre sans obstruction.

Fonctionnement sûr avant et après la centrifugation

Une bonne centrifugeuse à plaques PCR doit inclure un contrôle sûr du couvercle et un fonctionnement stable. Des fonctionnalités telles que le verrouillage du couvercle, l’avertissement de déséquilibre et le freinage en douceur contribuent à réduire les risques opérationnels. Les utilisateurs ne doivent pas contourner la protection de sécurité.

Tableau de sélection des centrifugeuses pour microplaques

Tableau de compatibilité des plaques

Liste de contrôle de l'acheteur

Avant de commander, confirmez le format de la plaque, le type de plaque, la méthode de scellage, la vitesse maximale/RCF, les performances d'accélération et de freinage, la méthode d'équilibrage, le verrouillage du couvercle, la détection de déséquilibre, le niveau de bruit, l'empreinte au sol, la tension, les exigences de prise et l'assistance du fournisseur.

Orientation finale de l'enquête

Lorsque vous contactez un fournisseur, indiquez le format et le type de plaque, la méthode de scellage, le débit quotidien, les exigences de rotation rapide attendues, la tension et les limites de l'espace de travail. Vous pouvez demander une recommandation de centrifugeuse  à GlanLab en fonction de vos besoins en matière de préparation de plaques PCR.

 

Erreurs de manipulation courantes

Choisir une centrifugeuse à tube plutôt qu'une centrifugeuse à plaques

Les centrifugeuses à tubes et les centrifugeuses à plaques sont conçues pour différents supports d'échantillons. Une centrifugeuse à tube générale ne doit pas être utilisée pour les plaques PCR à moins qu’un rotor de plaque compatible ne soit clairement spécifié.

Ignorer la compatibilité des plaques à 384 puits ou des plaques à jupe

Certains laboratoires commencent avec des plaques à 96 puits, mais passent ensuite aux formats à 384 puits ou à jupe. Le choix d’un modèle offrant une compatibilité plus large peut réduire les futurs besoins de remplacement.

Utilisation de valeurs de protocole fixes provenant de sources indépendantes

Les valeurs de vitesse et de temps doivent provenir des instructions sur les réactifs, du guidage des plaques, des manuels de centrifugeuse et des SOP du laboratoire. Les paramètres de centrifugation PCR universelle ne doivent pas être copiés sans vérification.

 

Conclusion

Une centrifugeuse à plaques PCR doit être sélectionnée pour sa compatibilité avec les plaques, ses performances de rotation rapide, sa méthode d'équilibrage, sa sécurité d'étanchéité et l'efficacité du flux de travail quotidien. Pour la préparation de plaques à 96 et 384 puits, les acheteurs doivent confirmer le format de la plaque, le type de plaque, la méthode de scellage, la plage de vitesse/RCF, les caractéristiques de sécurité et le débit avant de choisir un modèle.

GlanLab fournit des solutions de centrifugation sur plaques et de microplaques pour les laboratoires PCR/qPCR, les laboratoires de biologie moléculaire et les flux de travail de préparation d'échantillons à haut débit. Les utilisateurs peuvent partager leur format de plaque, leur méthode de scellage, leur tension et leurs exigences de manipulation quotidiennes avec GlanLab pour sélectionner une centrifugeuse appropriée,Contactez-nous.

 

FAQ

A quoi sert une centrifugeuse à plaques PCR ?

Il est principalement utilisé pour faire tourner rapidement les plaques PCR, collecter les gouttelettes des parois des puits, réduire les bulles et aider le liquide à se déposer au fond des puits.

Une centrifugeuse pour plaques PCR peut-elle gérer des plaques de 96 et 384 puits ?

Certains modèles prennent en charge les deux formats, mais les acheteurs doivent confirmer la compatibilité avec le type de plaque spécifique, la hauteur de la plaque et la méthode de scellage.

Une centrifugeuse pour microplaques est-elle identique à une centrifugeuse standard ?

Non. Une centrifugeuse pour microplaques est conçue pour les formats de plaques, tandis que les centrifugeuses standard sont souvent conçues pour les tubes, les bouteilles ou autres récipients à échantillons.

Ai-je besoin d’une centrifugeuse spéciale pour les plaques PCR à jupe ?

La centrifugeuse doit clairement supporter les plaques à jupe, demi-jupe ou sans jupe. Le dégagement et le support du cadre doivent être vérifiés avant l'achat.

Comment choisir une centrifugeuse à plaques 96 puits ?

Vérifiez la compatibilité des plaques, la plage de vitesse/RCF, la méthode d'équilibrage, la sécurité de l'étanchéité, l'accélération/freinage, l'empreinte au sol, le niveau de bruit et l'assistance du fournisseur.